Tomi Suomi

A crowdsourced analysis to identify ab initio molecular signatures predictive of susceptibility to viral infection (2018)

Nature Communications

Slim Fourati, Aarthi Talla, Mehrad Mahmoudian, Joshua G. Burkhart, Riku Klén, Ricardo Henao, Thomas Yu, Zafer Aydın, Ka Yee Yeung, Mehmet Eren Ahsen, Reem Almugbel, Samad Jahandideh, Xiao Liang, Torbjörn E.M. Nordling, Motoki Shiga, Ana Stanescu, Robert Vogel, The Respiratory Viral DREAM Challenge Consortium, Gaurav Pandey, Christopher Chiu, Micah T. McClain, Christopher W. Woods, Geoffrey S. Ginsburg, Laura L. Elo, Ephraim L. Tsalik, Lara M. Mangravite, Solveig K. Sieberts

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Phosphonormalizer: an R package for normalization of MS-based label-free phosphoproteomics (2018)

Bioinformatics

Sohrab Saraei, Tomi Suomi, Otto Kauko, Laura L. Elo

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

SimPhospho: a software tool enabling confident phosphosite assignment (2018)

Bioinformatics

Veronika Suni, Tomi Suomi, Tomoya Tsubosaka, Susumu Y. Imanishi, Laura L. Elo, Garry L. Corthals

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Enhanced differential expression statistics for data-independent acquisition proteomics (2017)

Scientific Reports

Tomi Suomi, Laura L. Elo

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Accurate detection of differential expression and splicing using low-level features (2017)

Methods in Molecular Biology

Suomi Tomi, Elo Laura L

(Vertaisarvioitu artikkeli kokoomateoksessa (A3))

ROTS: An R package for reproducibility-optimized statistical testing (2017)

PLoS Computational Biology

Tomi Suomi, Fatemeh Seyednasrollah, Maria K. Jaakkola, Thomas Faux,
Laura L. Elo

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

HIF prolyl hydroxylase PHD3 regulates translational machinery and glucose metabolism in clear cell renal cell carcinoma (2017)

Cancer and Metabolism

Miikkulainen P, Högel H, Rantanen K, Suomi T, Kouvonen P, Elo LL, Jaakkola PM

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Brief Isoflurane Anesthesia Produces Prominent Phosphoproteomic Changes in the Adult Mouse Hippocampus (2016)

ACS Chemical Neuroscience

Kohtala S, Theilmann W, Suomi T, Wigren HK, Porkka-Heiskanen T, Elo LL, Rokka A, Rantamäki T

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Using peptide-level proteomics data for detecting differentially expressed proteins. (2015)

Journal of Proteome Research

Suomi T, Corthals GL, Nevalainen OS, Elo LL.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Optimization of Statistical Methods Impact on Quantitative Proteomics Data (2015)

Journal of Proteome Research

Pursiheimo A, Vehmas AP, Afzal S, Suomi T, Chand T, Strauss L, Poutanen M, Rokka A, Corthals GL, Elo LL,

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Ota yhteyttä

Linkit

Julkaisut

Järjestä:

A crowdsourced analysis to identify ab initio molecular signatures predictive of susceptibility to viral infection (2018)

Phosphonormalizer: an R package for normalization of MS-based label-free phosphoproteomics (2018)

SimPhospho: a software tool enabling confident phosphosite assignment (2018)

Enhanced differential expression statistics for data-independent acquisition proteomics (2017)

Accurate detection of differential expression and splicing using low-level features (2017)

ROTS: An R package for reproducibility-optimized statistical testing (2017)

HIF prolyl hydroxylase PHD3 regulates translational machinery and glucose metabolism in clear cell renal cell carcinoma (2017)

Brief Isoflurane Anesthesia Produces Prominent Phosphoproteomic Changes in the Adult Mouse Hippocampus (2016)

Using peptide-level proteomics data for detecting differentially expressed proteins. (2015)

Optimization of Statistical Methods Impact on Quantitative Proteomics Data (2015)