Tomi
Suomi
Postdoctoral Researcher, Turku Bioscience Centre
Docent, Faculty of Medicine
Publications
Compressive stress-mediated p38 activation required for ERα + phenotype in breast cancer (2021)
Nature Communications
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry in Metaproteomics of Gut Microbiota—Implementation and Computational Analysis (2020)
Journal of Proteome Research
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
A Data Analysis Protocol for Quantitative Data-Independent Acquisition Proteomics. (2019)
Methods in Molecular Biology
(Vertaisarvioitu artikkeli kokoomateoksessa (A3))
A systematic evaluation of normalization methods in quantitative label-free proteomics (2018)
Briefings in Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
SimPhospho: a software tool enabling confident phosphosite assignment (2018)
Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
A comprehensive evaluation of popular proteomics software workflows for label-free proteome quantification and imputation (2018)
Briefings in Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
A crowdsourced analysis to identify ab initio molecular signatures predictive of susceptibility to viral infection (2018)
Nature Communications
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Phosphonormalizer: an R package for normalization of MS-based label-free phosphoproteomics (2018)
Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
HIF prolyl hydroxylase PHD3 regulates translational machinery and glucose metabolism in clear cell renal cell carcinoma (2017)
Cancer and Metabolism
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Enhanced differential expression statistics for data-independent acquisition proteomics (2017)
Scientific Reports
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))