Tomi Suomi

Benchmarking tools for detecting longitudinal differential expression in proteomics data allows establishing a robust reproducibility optimization regression approach (2022)

Nature Communications

Välikangas Tommi, Suomi Tomi, Chandler Courtney E., Scott Alison J., Tran Bao Q., Ernst Robert K., Goodlett David R., Elo Laura L.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

COVID-19-specific transcriptomic signature detectable in blood across multiple cohorts (2022)

Frontiers in Genetics

Välikangas Tommi, Junttila Sini, Rytkönen Kalle T, Kukkonen-Macchi Anu, Suomi Tomi, Elo Laura L

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Statistical and machine learning methods to study human CD4+ T cell proteome profiles (2022)

Immunology Letters

Suomi Tomi, Elo Laura L

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Introducing untargeted data-independent acquisition for metaproteomics of complex microbial samples (2022)

ISME Communications

Pietilä Sami, Suomi Tomi, Elo L. Laura

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Improved risk prediction of chemotherapy-induced neutropenia-model development and validation with real-world data (2022)

Cancer Medicine

Venäläinen Mikko S., Heervä Eetu, Hirvonen Outi, Saraei Sohrab, Suomi Tomi, Mikkola Toni, Bärlund Maarit, Jyrkkiö Sirkku, Laitinen Tarja, Elo Laura L.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Computational solutions for spatial transcriptomics (2022)

Computational and Structural Biotechnology Journal

Kleino Iiivari, Frolovaitė Paulina, Suomi Tomi, Elo Laura L

(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))

Type 1 Diabetes in Children With Genetic Risk May Be Predicted Very Early With a Blood miRNA (2022)

Diabetes Care

Suomi Tomi, Kalim Ubaid Ullah, Rasool Omid, Laiho Asta, Kallionpää Henna, Vähä-Mäkilä Mari, Nurmio Mirja, Mykkänen Juha, Härkönen Taina, Hyöty Heikki, Ilonen Jorma, Veijola Riitta, Toppari Jorma, Knip Mikael, Elo Laura L, Lahesmaa Riitta

(Kirjoitus tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (B1))

Correction to: PhosPiR: an automated phosphoproteomic pipeline in R (vol 23, bbab510, 2022) (2022)

Briefings in Bioinformatics

Hong Ye, Flinkman Dani, Suomi Tomi, Pietilä Sami, James Peter, Coffey Eleanor, Elo Laura L

(O2 Muu julkaisu )

Compressive stress-mediated p38 activation required for ERα + phenotype in breast cancer (2021)

Nature Communications

Munne Pauliina M., Martikainen Lahja, Räty Iiris, Bertula Kia, Nonappa, Ruuska Janika, Ala-Hongisto Hanna, Peura Aino, Hollmann Babette, Euro Lilya, Yavuz Kerim, Patrikainen Linda, Salmela Maria, Pokki Juho, Kivento Mikko, Väänänen Juho, Suomi Tomi, Nevalaita Liina, Mutka Minna, Kovanen Panu, Leidenius Marjut, Meretoja Tuomo, Hukkinen Katja, Monni Outi, Pouwels Jeroen, Sahu Biswajyoti, Mattson Johanna, Joensuu Heikki, Heikkilä Päivi, Elo Laura L., Metcalfe Ciara, Junttila Melissa R., Ikkala Olli, Klefström Juha

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Data analysis tools for mass spectrometry proteomics (2021)

Suomi Tomi

(G5 Artikkeliväitöskirja)

Contact

Links

Publications

Sort by:

Benchmarking tools for detecting longitudinal differential expression in proteomics data allows establishing a robust reproducibility optimization regression approach (2022)

COVID-19-specific transcriptomic signature detectable in blood across multiple cohorts (2022)

Statistical and machine learning methods to study human CD4+ T cell proteome profiles (2022)

Introducing untargeted data-independent acquisition for metaproteomics of complex microbial samples (2022)

Improved risk prediction of chemotherapy-induced neutropenia-model development and validation with real-world data (2022)

Computational solutions for spatial transcriptomics (2022)

Type 1 Diabetes in Children With Genetic Risk May Be Predicted Very Early With a Blood miRNA (2022)

Correction to: PhosPiR: an automated phosphoproteomic pipeline in R (vol 23, bbab510, 2022) (2022)

Compressive stress-mediated p38 activation required for ERα + phenotype in breast cancer (2021)

Data analysis tools for mass spectrometry proteomics (2021)