Tomi Suomi

Computational solutions for spatial transcriptomics (2022)

Computational and Structural Biotechnology Journal

Kleino Iiivari, Frolovaitė Paulina, Suomi Tomi, Elo Laura L

(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))

Improved risk prediction of chemotherapy-induced neutropenia-model development and validation with real-world data (2022)

Cancer Medicine

Venäläinen Mikko S., Heervä Eetu, Hirvonen Outi, Saraei Sohrab, Suomi Tomi, Mikkola Toni, Bärlund Maarit, Jyrkkiö Sirkku, Laitinen Tarja, Elo Laura L.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Type 1 Diabetes in Children With Genetic Risk May Be Predicted Very Early With a Blood miRNA (2022)

Diabetes Care

Suomi Tomi, Kalim Ubaid Ullah, Rasool Omid, Laiho Asta, Kallionpää Henna, Vähä-Mäkilä Mari, Nurmio Mirja, Mykkänen Juha, Härkönen Taina, Hyöty Heikki, Ilonen Jorma, Veijola Riitta, Toppari Jorma, Knip Mikael, Elo Laura L, Lahesmaa Riitta

(Kirjoitus tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (B1))

Compressive stress-mediated p38 activation required for ERα + phenotype in breast cancer (2021)

Nature Communications

Munne Pauliina M., Martikainen Lahja, Räty Iiris, Bertula Kia, Nonappa, Ruuska Janika, Ala-Hongisto Hanna, Peura Aino, Hollmann Babette, Euro Lilya, Yavuz Kerim, Patrikainen Linda, Salmela Maria, Pokki Juho, Kivento Mikko, Väänänen Juho, Suomi Tomi, Nevalaita Liina, Mutka Minna, Kovanen Panu, Leidenius Marjut, Meretoja Tuomo, Hukkinen Katja, Monni Outi, Pouwels Jeroen, Sahu Biswajyoti, Mattson Johanna, Joensuu Heikki, Heikkilä Päivi, Elo Laura L., Metcalfe Ciara, Junttila Melissa R., Ikkala Olli, Klefström Juha

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Data analysis tools for mass spectrometry proteomics (2021)

Suomi Tomi

(Artikkeliväitöskirja (G5))

PhosPiR: an automated phosphoproteomic pipeline in R (2021)

Briefings in Bioinformatics

Hong Ye, Flinkman Dani, Suomi Tomi, Pietilä Sami, James Peter, Coffey Eleanor, Elo Laura L

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry in Metaproteomics of Gut Microbiota—Implementation and Computational Analysis (2020)

Journal of Proteome Research

Juhani Aakko, Sami Pietilä, Tomi Suomi, Mehrad Mahmoudian, Raine Toivonen, Petri Kouvonen, Anne Rokka, Arno Hänninen, Laura L. Elo

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A Data Analysis Protocol for Quantitative Data-Independent Acquisition Proteomics. (2019)

Methods in Molecular Biology

Pietilä S, Suomi T, Aakko J, Elo LL.

(Vertaisarvioitu artikkeli kokoomateoksessa (A3))

A systematic evaluation of normalization methods in quantitative label-free proteomics (2018)

Briefings in Bioinformatics

Tommi Välikangas, Tomi Suomi, Laura L. Elo

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A comprehensive evaluation of popular proteomics software workflows for label-free proteome quantification and imputation (2018)

Briefings in Bioinformatics

Välikangas T, Suomi T, Elo LL

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Ota yhteyttä

Linkit

Julkaisut

Järjestä:

Computational solutions for spatial transcriptomics (2022)

Improved risk prediction of chemotherapy-induced neutropenia-model development and validation with real-world data (2022)

Type 1 Diabetes in Children With Genetic Risk May Be Predicted Very Early With a Blood miRNA (2022)

Compressive stress-mediated p38 activation required for ERα + phenotype in breast cancer (2021)

Data analysis tools for mass spectrometry proteomics (2021)

PhosPiR: an automated phosphoproteomic pipeline in R (2021)

Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry in Metaproteomics of Gut Microbiota—Implementation and Computational Analysis (2020)

A Data Analysis Protocol for Quantitative Data-Independent Acquisition Proteomics. (2019)

A systematic evaluation of normalization methods in quantitative label-free proteomics (2018)

A comprehensive evaluation of popular proteomics software workflows for label-free proteome quantification and imputation (2018)