Tero Aittokallio

Interactive visual analysis of drug-target interaction networks using Drug Target Profiler, with applications to precision medicine and drug repurposing (2020)

Briefings in Bioinformatics

Tanoli Ziaurrehman, Alam Zaid, Ianevski Aleksandr, Wennerberg Krister, Vähä-Koskela Markus, Aittokallio Tero

(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))

Multiobjective optimization identifies cancer-selective combination therapies (2020)

PLoS Computational Biology

Pulkkinen Otto I, Gautam Prson, Mustonen Ville, Aittokallio Tero

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Cost-effective survival prediction for patients with advanced prostate cancer using clinical trial and real-world hospital registry datasets (2020)

International Journal of Medical Informatics

Mika Murtojärvi, Anni S. Halkola, Antti Airola, Teemu D. Laajala, Tuomas Mirtti, Tero Aittokallio, Tapio Pahikkala

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Phosphoproteome and drug-response effects mediated by the three protein phosphatase 2A inhibitor proteins CIP2A, SET, and PME-1 (2020)

Journal of Biological Chemistry

Kauko O, Imanishi SY, Kulesskiy E, Yetukuri L, Laajala TD, Sharma M, Pavic K, Aakula A, Rupp C, Jumppanen M, Haapaniemi P, Ruan L, Yadav B, Suni V, Varila T, Reimand J, Corthals GL, Aittokallio T, Wennerberg K, Westermarck J

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Modelling of killer T-cell and cancer cell subpopulation dynamics under immuno- and chemotherapies (2020)

Journal of Theoretical Biology

Anni S. Halkola, Kalle Parvinen, Hanna Kasanen, Satu Mustjoki, Tero Aittokallio

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A relational database to identify differentially expressed genes in the endometrium and endometriosis lesions (2020)

Scientific Data

Gabriel M, Fey V, Heinosalo T, Adhikari P, Rytkönen K, Komulainen T, Huhtinen K, Laajala TD, Siitari H, Virkki A, Suvitie P, Kujari H, Aittokallio T, Perheentupa A, Poutanen M

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

SynToxProfiler: An interactive analysis of drug combination synergy, toxicity and efficacy (2020)

PLoS Computational Biology

Ianevski A, Timonen S, Kononov A, Aittokallio T, Giri AK

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Breeze: an integrated quality control and data analysis application for high-throughput drug screening (2020)

Bioinformatics

Swapnil Potdar, Aleksandr Ianevski, John-Patrick Mpindi, Dmitrii Bychkov, Clément Fiere, Philipp Ianevski, Bhagwan Yadav, Krister Wennerberg, Tero Aittokallio, Olli Kallioniemi, Jani Saarela, Päivi Östling

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A harmonized meta-knowledgebase of clinical interpretations of somatic genomic variants in cancer (2020)

Nature Genetics

Alex H. Wagner, Brian Walsh, Georgia Mayfield, David Tamborero, Dmitriy Sonkin, Kilannin Krysiak, Jordi Deu-Pons, Ryan P. Duren, Jianjiong Gao, Julie McMurry, Sara Patterson, Catherine del Vecchio Fitz, Beth A. Pitel, Ozman U. Sezerman, Kyle Ellrott, Jeremy L. Warner, Damian T. Rieke, Tero Aittokallio, Ethan Cerami, Deborah I. Ritter, Lynn M. Schriml, Robert R. Freimuth, Melissa Haendel, Gordana Raca, Subha Madhavan, Michael Baudis, Jacques S. Beckmann, Rodrigo Dienstmann, Debyani Chakravarty,Xuan Shirley Li, Susan Mockus, Olivier Elemento, Nikolaus Schultz, Nuria Lopez-Bigas, Mark Lawler, Jeremy Goecks, Malachi Griffith, Obi L. Griffith, Adam A. Margolin

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Leveraging multi-way interactions for systematic prediction of pre-clinical drug combination effects (2020)

Nature Communications

Julkunen H., Cichonska A., Gautam P., Szedmak S., Douat J., Pahikkala T., Aittokallio T., Rousu J.

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Ota yhteyttä

Linkit

Julkaisut

Järjestä:

Interactive visual analysis of drug-target interaction networks using Drug Target Profiler, with applications to precision medicine and drug repurposing (2020)

Multiobjective optimization identifies cancer-selective combination therapies (2020)

Cost-effective survival prediction for patients with advanced prostate cancer using clinical trial and real-world hospital registry datasets (2020)

Phosphoproteome and drug-response effects mediated by the three protein phosphatase 2A inhibitor proteins CIP2A, SET, and PME-1 (2020)

Modelling of killer T-cell and cancer cell subpopulation dynamics under immuno- and chemotherapies (2020)

A relational database to identify differentially expressed genes in the endometrium and endometriosis lesions (2020)

SynToxProfiler: An interactive analysis of drug combination synergy, toxicity and efficacy (2020)

Breeze: an integrated quality control and data analysis application for high-throughput drug screening (2020)

A harmonized meta-knowledgebase of clinical interpretations of somatic genomic variants in cancer (2020)

Leveraging multi-way interactions for systematic prediction of pre-clinical drug combination effects (2020)