Silva Uusi-Heikkilä profiilikuva
Silva
Uusi-Heikkilä
dosentti, biologian laitos
PhD in Evolutionary Ecology. Docent in Evolutionary Biology
Hevosen suolistomikrobisto ja suolistotulehduksen (IBD) aiheuttamat molekyylitason muutokset suolistossa: FINEBIOME (Finnish eDNA/equine microbiome). Kalastusevoluutio ja adaptiivinen potentiaali.

Ota yhteyttä

Natura, yliopistonmäki
20014
Turku

Asiantuntijuusalueet

Evoluutiobiologia
Kokeellinen tutkimus
Molekyylibiologia
Uuden sukupolven sekvensointimenetelmät
Genomiikka
Mikrobiomit.

Tutkimus

Parhaillaan tutkin kroonista suolistotulehdusta (IBD) ja sen vaikutusta hevosen suolistomikrobistoon sekä suoliston mitokondrioiden toimintaan. 

Tutkin myös kokeellisesti ihmisen aiheuttamien ympäristömuutosten vaikutusta kalapopulaatioihin. Pääasiallisesti tutkin kokoon kohdistuvan kalastuksen vaikutuksia ja viime vuosina olemme tutkimusryhmässäni altistaneet kalapopulaatioita muille samanaikaisille stressitekijöille kuten lämpötilan muutoksille, nälkiintymiselle, saasteille ja tulehduksille. Tutkimme näiden tekijöiden vaikutuksia sekä kalojen ilmiasuun että perimään (koko genomin sekvensointi, bisulfaattisekvensointi, RNA-sekvensointi). Tutkimme myös miten lämpötilastressi, hypoksia ja genotyyppi vaikuttavat kalojen ihon mikrobiston koostumukseeen. 

Olen myös tehnyt yhteisöekologiatutkimusta mallintamalla akvaattisia ravintoverkkoja ja muutoksia niiden dynamiikassa.  

Julkaisut

Järjestä:

Turbidity affects social dynamics in Trinidadian guppies (2015)

Behavioral Ecology and Sociobiology
Karoline K. Borner, Stefan Krause, Thomas Mehner, Silva Uusi-Heikkilä, Indar W. Ramnarine, Jens Krause
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

The evolutionary legacy of size-selective harvesting extends from genes to populations (2015)

Evolutionary Applications
Silva Uusi-Heikkilä, Andrew R. Whiteley, Anna Kuparinen, Shuichi Matsumura, Paul A. Venturelli, Christian Wolter, Jon Slate, Craig R. Primmer, Thomas Meinelt, Shaun S. Killen, David Bierbach, Giovanni Polverino, Arne Ludwig, Robert Arlinghaus
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Isoja emokaloja tarvitaan (2015)

Suomen Kalastuslehti
Anna Kristiina Kuparinen, Silva Uusi-Heikkilä, Anssi Vainikka
(Artikkeli ammattilehdessä tai kirjoitus ammatillisessa blogissa (D1))

Evolutionary impact assessment: accounting for evolutionary consequences of fishing in an ecosystem approach to fisheries management (2014)

Fish and Fisheries
Ane T Laugen, Georg H Engelhard, Rebecca Whitlock, Robert Arlinghaus, Dorothy J Dankel, Erin S Dunlop, Anne M Eikeset, Katja Enberg, Christian Jørgensen, Shuichi Matsumura, Sébastien Nusslé, Davnah Urbach, Loїc Baulier, David S Boukal, Bruno Ernande, Fiona D Johnston, Fabian Mollet, Heidi Pardoe, Nina O Therkildsen, Silva Uusi-Heikkilä, Anssi Vainikka, Mikko Heino, Adriaan D Rijnsdorp, Ulf Dieckmann
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Can fisheries-induced evolution shift reference points for fisheries management? (2013)

ICES Journal of Marine Science
Heino M, Baulier L, Boukal DS, Ernande B, Johnston FD, Mollet FM, Pardoe H, Therkildsen NO, Uusi-Heikkila S, Vainikka A, Arlinghaus R, Dankel DJ, Dunlop ES, Eikeset AM, Enberg K, Engelhard GH, Jorgensen C, Laugen AT, Matsumura S, Nussle S, Urbach D, Whitlock R, Rijnsdorp AD, Dieckmann U
(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))