Kaisa Huhtinen

Targeting DNA Homologous Repair Proficiency With Concomitant Topoisomerase II and c-Abl Inhibition (2021)

Frontiers in Oncology

Siddiqui Arafat, Tumiati Manuela, Joko Alia, Sandholm Jouko, Roering, Aakko Pia Sofia, Vainionpää Reetta, Kaipio Katja, Huhtinen Kaisa, Kauppi Liisa, Tuomela Johanna, Hietanen Sakari

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Aggressive and recurrent ovarian cancers upregulate ephrinA5, a non-canonical effector of EphA2 signaling duality (2021)

Scientific Reports

Jukonen Joonas, Moyano-Galceran Lidia, Höpfner Katrin, Pietilä Elina A, Lehtinen Laura, Huhtinen Kaisa, Gucciardo Erica, Hynninen Johanna, Hietanen Sakari, Grénman Seija, Ojala Päivi M, Carpén Olli, Lehti Kaisa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

PRISM: Recovering cell type specific expression profiles from individual composite RNA-seq samples (2021)

Bioinformatics

Häkkinen Antti, Zhang Kaiyang, Alkodsi Amjad, Andersson Noora, Pekcan Erkan Erdogan, Dai Jun, Kaipio Katja, Lamminen Tarja, Mansuri Naziha, Huhtinen Kaisa, Vähärautio Anna, Carpén Olli, Hynninen Johanna, Hietanen Sakari, Lehtonen Rainer, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

FUNGI: Fusion Gene Integration Toolset (2021)

Bioinformatics

Cervera Alejandra, Rausio Heidi, Kähkönen Tiia, Andersson Noora, Partel Gabriele, Rantanen Ville, Paciello Giulia, Ficarra Elisa, Hynninen Johanna, Hietanen Sakari, Carpén Olli, Lehtonen Rainer, Hautaniemi Sampsa, Huhtinen Kaisa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A longitudinal analysis of CA125 glycoforms in the monitoring and follow up of high grade serous ovarian cancer (2020)

Gynecologic Oncology

Liina Salminen, Nimrah Nadeem, Shruti Jain, Seija Grènman, Olli Carpén, Sakari Hietanen, Sinikka Oksa, Urpo Lamminmäki, Kim Pettersson, Kamlesh Gidwani, Kaisa Huhtinen, Johanna Hynninen

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Glycovariant-based lateral flow immunoassay to detect ovarian cancer–associated serum CA125 (2020)

Communications Biology

Sherif Bayoumy, Heidi Hyytiä, Janne Leivo, Sheikh M. Talha, Kaisa Huhtinen, Matti Poutanen, Johanna Hynninen, Antti Perheentupa, Urpo Lamminmäki, Kamlesh Gidwani & Kim Pettersson

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

HE4 in the evaluation of tumor load and prognostic stratification of high grade serous ovarian carcinoma (2020)

Acta Oncologica

Liina Salminen, Kamlesh Gidwani, Seija Grènman, Olli Carpén, Sakari Hietanen, Kim Pettersson, Kaisa Huhtinen, Johanna Hynninen

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

ALDH1A1-related stemness in high-grade serous ovarian cancer is a negative prognostic indicator but potentially targetable by EGFR/mTOR-PI3K/aurora kinase inhibitors (2020)

Journal of Pathology

Katja Kaipio, Ping Chen, Pia Roering, Kaisa Huhtinen, Piia Mikkonen, Päivi Östling, Laura Lehtinen, Naziha Mansuri, Taina Korpela, Swapnil Potdar, Johanna Hynninen, Annika Auranen, Seija Grénman, Krister Wennerberg, Sampsa Hautaniemi, Olli Carpén

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

RNA-seq analysis of high-grade serous ovarian cancer patients before and after chemotherapy reveals chemoresistance-associated genes and pathways (2020)

Clinical Cancer Research

Jamalzadeh S, Zhang KY, Hakkinen A, Huhtinen K, Hynninen J, Andersson N, Mansuri N, Carpen O, Erdogan E, Dai J, Vaharautio A, Hietanen S, Oikkonen J, Lehtonen R, Hautaniemi S

(O2 Muu julkaisu )

Analysis of single-cell RNA-seq data from ovarian cancer samples before and after chemotherapy links stress-related transcriptional profile with chemotherapy resistance (2020)

bioRxiv

Zhang K, Erkan EP, Dai J, Andersson N, Kaipio K, Lamminen T, Mansuri N, Huhtinen K, Carpen O, Hynninen J, others

(O2 Muu julkaisu )

Ota yhteyttä

Linkit

Asiantuntijuusalueet

Julkaisut

Järjestä:

Targeting DNA Homologous Repair Proficiency With Concomitant Topoisomerase II and c-Abl Inhibition (2021)

Aggressive and recurrent ovarian cancers upregulate ephrinA5, a non-canonical effector of EphA2 signaling duality (2021)

PRISM: Recovering cell type specific expression profiles from individual composite RNA-seq samples (2021)

FUNGI: Fusion Gene Integration Toolset (2021)

A longitudinal analysis of CA125 glycoforms in the monitoring and follow up of high grade serous ovarian cancer (2020)

Glycovariant-based lateral flow immunoassay to detect ovarian cancer–associated serum CA125 (2020)

HE4 in the evaluation of tumor load and prognostic stratification of high grade serous ovarian carcinoma (2020)

ALDH1A1-related stemness in high-grade serous ovarian cancer is a negative prognostic indicator but potentially targetable by EGFR/mTOR-PI3K/aurora kinase inhibitors (2020)

RNA-seq analysis of high-grade serous ovarian cancer patients before and after chemotherapy reveals chemoresistance-associated genes and pathways (2020)

Analysis of single-cell RNA-seq data from ovarian cancer samples before and after chemotherapy links stress-related transcriptional profile with chemotherapy resistance (2020)