Hannu Lehti toimii akatemiatutkijana Invest lippulaiva keskuksessa. Hänen tutkimukselliset interessit liittyvät ylisukupolvisiin vaikutuksiin, sosiaaliseen ja koulutukselliseen kerrostuneisuuteen, koulutuksen saavuttamiseen, sosiogenomiikkaan. Suomen Akatemian rahoittamassa hankkeessa Lehti tutkii, miten geenien ja sosiaalisen ympäristön vuorovaikutus selittää koulutusta ja sosiaalista asemaa.

Väitöskirjassaan hän tutki vanhempien ja sukulaisten sosioekonomisia vaikutuksia ja miten sukulaiset kompensoivat vanhempien huonoa sosioekomista asemaa. Hannu Lehden tutkimuksia on julkaistu muun muassa seuraavissa tieteellisissä aikauskirjoissa: European Sociological Review, Research in Social Stratification and Mobility, Research on Finnish Society, Yhteiskuntapolitiikka.