Väitös (lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia): FM Anni Soikkeli
Aika
2.5.2025 klo 12.00 - 16.00
FM Anni Soikkeli esittää väitöskirjansa ”Somatic hypermutation targeting activity of proto-oncogenic enhancers” julkisesti tarkastettavaksi Turun yliopistossa perjantaina 2.5.2025 klo 12.00 (Turun yliopisto, Medisiina D, Säätiö-sali, Kiinamyllynkatu 10, Turku).
Vastaväittäjänä toimii dosentti Eeva Auvinen (Helsingin yliopisto) ja kustoksena dosentti Jukka Alinikula (Turun yliopisto). Tilaisuus on suomenkielinen. Väitöksen alana on lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia.
Väitöskirja yliopiston julkaisuarkistossa: https://urn.fi/URN:ISBN:978-952-02-0099-2 (kopioi linkki selaimeen).
***
Tiivistelmä väitöstutkimuksesta:
Genomiin kertyy mutaatioita kemiallisten ja fysikaalisten tekijöiden seurauksena. Osan näistä tekijöistä, kuten DNA:n sytosiini-emästen rakennetta muuttavat AID/APOBEC-perheen entsyymit, elimistö tuottaa itse. Kyseiset entsyymit ovat tärkeitä elimistöä tehokkaasti suojaavien vasta-aineiden muodostumisessa B-lymfosyyteissä (AID) sekä virusinfektioiden torjunnassa (APOBEC). Näiden entsyyminen aiheuttamien mutaatioiden kohdentuminen väärään paikkaan genomissa voi kuitenkin lisätä riskiä syövän kehittymiselle.
Väitöstutkimuksessani selvitettiin AID/APOBEC-entsyymien aiheuttamien mutaatioiden kertymistä virusten ja ihmisen esisyöpägeeneihin. Erityisesti tutkittiin, pohjautuuko AID-entsyymin aiheuttamien mutaatioiden kohdentuminen esisyöpägeenien säätelyalueilta löytyviin elementteihin. Vastaavien elementtien on aiemmin näytetty kohdentavan tätä ns. somaattista hypermutaatiota vasta-ainegeenien alueelle. Tutkimuksen tulokset osoittivat, että polyoomavirusten LT-geeneistä löytyi sekä AID että APOBEC3 -entsyymien aiheuttamia mutaatioita. Osa näistä mutaatioista johti lopulta lyhentyneen LT-proteiinin tuottoon, mikä on yhdistetty polyoomaviruksiin liittyvien syöpien muodostumiseen. Lisäksi polyoomavirusten geenien säätelyalueilta löytyi somaattista hypermutaatioita kohdentavia elementtejä. Vastaavanlaisia elementtejä löydettiin myös ihmisen BCL6-esisyöpägeenin säätelyalueelta. Alustavat tulokset viittaavat elementtien kohdentavan mutaatioita BCL6-geenin ensimmäiseen introniin, jonka on toistuvasti näytetty mutatoituvan B-solulähtöisissä lymfoomissa.
Tutkimuksessa näytettiin, että somaattista hypermutaatiota kohdentavat elementit ovat genomissa huomattavan yleisiä ja niiden toiminta ei välttämättä rajoitu B-lymfosyytteihin. Elementtien kyky kohdentaa mutaatioita lähellä sijaitseviin geeneihin voi osoittautua merkittäväksi taudinaiheuttamismekanismiksi tiettyjen sairauksien taustalla, mutta lisätutkimukset aiheesta ovat tarpeen. Tulevaisuudessa näitä tietoja voidaan mahdollisesti hyödyntää ainakin polyoomaviruksiin liittyvien vakavien sairauksien sekä BCL6-proteiinin toimintahäiriöihin liittyvien lymfoomien diagnostiikan ja hoidon kehittämisessä.
Vastaväittäjänä toimii dosentti Eeva Auvinen (Helsingin yliopisto) ja kustoksena dosentti Jukka Alinikula (Turun yliopisto). Tilaisuus on suomenkielinen. Väitöksen alana on lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia.
Väitöskirja yliopiston julkaisuarkistossa: https://urn.fi/URN:ISBN:978-952-02-0099-2 (kopioi linkki selaimeen).
***
Tiivistelmä väitöstutkimuksesta:
Genomiin kertyy mutaatioita kemiallisten ja fysikaalisten tekijöiden seurauksena. Osan näistä tekijöistä, kuten DNA:n sytosiini-emästen rakennetta muuttavat AID/APOBEC-perheen entsyymit, elimistö tuottaa itse. Kyseiset entsyymit ovat tärkeitä elimistöä tehokkaasti suojaavien vasta-aineiden muodostumisessa B-lymfosyyteissä (AID) sekä virusinfektioiden torjunnassa (APOBEC). Näiden entsyyminen aiheuttamien mutaatioiden kohdentuminen väärään paikkaan genomissa voi kuitenkin lisätä riskiä syövän kehittymiselle.
Väitöstutkimuksessani selvitettiin AID/APOBEC-entsyymien aiheuttamien mutaatioiden kertymistä virusten ja ihmisen esisyöpägeeneihin. Erityisesti tutkittiin, pohjautuuko AID-entsyymin aiheuttamien mutaatioiden kohdentuminen esisyöpägeenien säätelyalueilta löytyviin elementteihin. Vastaavien elementtien on aiemmin näytetty kohdentavan tätä ns. somaattista hypermutaatiota vasta-ainegeenien alueelle. Tutkimuksen tulokset osoittivat, että polyoomavirusten LT-geeneistä löytyi sekä AID että APOBEC3 -entsyymien aiheuttamia mutaatioita. Osa näistä mutaatioista johti lopulta lyhentyneen LT-proteiinin tuottoon, mikä on yhdistetty polyoomaviruksiin liittyvien syöpien muodostumiseen. Lisäksi polyoomavirusten geenien säätelyalueilta löytyi somaattista hypermutaatioita kohdentavia elementtejä. Vastaavanlaisia elementtejä löydettiin myös ihmisen BCL6-esisyöpägeenin säätelyalueelta. Alustavat tulokset viittaavat elementtien kohdentavan mutaatioita BCL6-geenin ensimmäiseen introniin, jonka on toistuvasti näytetty mutatoituvan B-solulähtöisissä lymfoomissa.
Tutkimuksessa näytettiin, että somaattista hypermutaatiota kohdentavat elementit ovat genomissa huomattavan yleisiä ja niiden toiminta ei välttämättä rajoitu B-lymfosyytteihin. Elementtien kyky kohdentaa mutaatioita lähellä sijaitseviin geeneihin voi osoittautua merkittäväksi taudinaiheuttamismekanismiksi tiettyjen sairauksien taustalla, mutta lisätutkimukset aiheesta ovat tarpeen. Tulevaisuudessa näitä tietoja voidaan mahdollisesti hyödyntää ainakin polyoomaviruksiin liittyvien vakavien sairauksien sekä BCL6-proteiinin toimintahäiriöihin liittyvien lymfoomien diagnostiikan ja hoidon kehittämisessä.
Viestintä