Tapio
Lönnberg
Senior Research Fellow, Turku Bioscience Centre
InFLAMES Flagship
Docent, Biotechnology
PhD
Single-cell immunogenomics research group at Turku Bioscience Centre; InFLAMES Flagship
Links
Areas of expertise
Single-cell genomics
immunology
Biography
- Phd 2012, University of Turku, supervised by Prof. Riitta Lahesmaa and Prof. Matej Orešič
- Postdoc 2023-2016, Teichmann lab, EMBL-EBI and Wellcome Trust Sanger Institute, UK
- Academy of Finland postdoc 2017-2020, Turku Bioscience Centre, University of Turku
- 2021- Group Leader at InFLAMES Flagship
- Secretary of the Finnish Society for Immunology
Teaching
- Modern biotechnologies and bioinformatics
- Medical biotechnology
- Advanced Immunology
Research
Our research aims at gaining deeper understanding of cell fate decisions in the immune system. We leverage single-cell and spatial omics to explore phenotypic heterogeneity beyond the immune cell subsets defined by the expression of cell surface markers. Our current research encompasses arthritic, autoimmune and cardiovascular diseases, aiming to identify core gene modules that are associated with disease state and can be exploited for more efficient diagnosis, patient stratification, and therapies.
Publications
Gene Regulatory Network Analysis of Decidual Stromal Cells and Natural Killer Cells (2024)
Reproductive Sciences
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Single-cell transcriptome analysis of the early immune response in the lymph nodes of Borrelia burgdorferi-infected mice (2024)
Microbes and Infection
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Single-cell characterisation of tissue homing CD4 + and CD8 + T cell clones in immune-mediated refractory arthritis (2024)
Molecular Medicine
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Single-cell characterization of anti-LAG-3 and anti-PD-1 combination treatment in patients with melanoma (2023)
Journal of Clinical Investigation
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
PIM kinases regulate early human Th17 cell differentiation (2023)
Cell Reports
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Dissecting the polygenic basis of atherosclerosis via disease-associated cell state signatures (2023)
American Journal of Human Genetics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Transinteractome analysis reveals distinct niche requirements for isotype-based plasma cell subsets in the bone marrow (2023)
European Journal of Immunology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Single-cell characterization of leukemic and non-leukemic immune repertoires in CD8+ T-cell large granular lymphocytic leukemia (2022)
Nature Communications
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Cell type markers indicate distinct contributions of decidual stromal cells and natural killer cells in preeclampsia (2022)
Reproduction
(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))
Evolution and modulation of antigen-specific T cell responses in melanoma patients (2022)
Nature Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )