Olli
Pentikäinen
Professor, Institute of Biomedicine
InFLAMES Flagship
PhD
Links
Areas of expertise
Computer-Dependent Drug Discovery
Molecular Modeling
Protein structure-function relationship
Protein-protein interaction
Biography
Education:
MSc in (organic) chemistry 1995 (University of Joensuu, Finland)
PhD in Biochemistry 2003 (Åbo Akademi University)
Adjunct Professor in Biochemistry 2005- (University of Turku)
Positions:
2017- Professor of Medicinal Chemistry (University of Turku) 8/2017
2011- Senior Lecturer in Cell and Molecular Biology (University of Jyväskylä)
2015 Visiting Senior Scientist (University of Innsbruck, Austria)
2005-2006 Visiting Senior Scientist (University of Bristol, UK)
1999-2005 Manager in Molecular Discovery (FBD Ltd)
Research
Our research focuses on discovery of efficient drug candidates and development of novel methods for that purpose. Especially our research on cancer drug targets that have been considered highly difficult, together with risk analysis of drug candidates, pave the road for safer drugs.
Publications
Building shape-focused pharmacophore models for effective docking screening (2024)
Journal of cheminformatics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Atomistic simulations reveal impacts of missense mutations on the structure and function of SynGAP1 (2024)
Briefings in Bioinformatics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Oxazolidinones: Are they only good for the discovery of antibiotics? A worm's eye view (2023)
Journal of Molecular Structure
(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))
Virtual Screening Strategy to Identify Retinoic Acid-Related Orphan Receptor γt Modulators (2023)
Molecules
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Computational Study on the Inhibitory Effect of Natural Compounds against the SARS-CoV-2 Proteins (2022)
Bioinorganic Chemistry and Applications
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Optimization of Cavity-Based Negative Images to Boost Docking Enrichment in Virtual Screening (2022)
Journal of Chemical Information and Modeling
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Ligand-Enhanced Negative Images Optimized for Docking Rescoring (2022)
International Journal of Molecular Sciences
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Rational design, optimization, and biological evaluation of novel α-Phosphonopropionic acids as covalent inhibitors of Rab geranylgeranyl transferase (2022)
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Sdfconf: A Novel, Flexible, and Robust Molecular Data Management Tool (2022)
Journal of Chemical Information and Modeling
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Substrate Selectivity of Coumarin Derivatives by Human CYP1 Enzymes: In Vitro Enzyme Kinetics and In Silico Modeling (2021)
ACS Omega
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))