Manu
Tamminen
Docent, Department of Biology
Academy Research Fellow, Physiology and Genetics
PhD, Docent
Contact
Areas of expertise
Molecular biology
Bioinformatics
Microbial Genetics
Microbial Ecology
Biography
- MSc, University of Turku, 2002
- PhD, University of Helsinki, 2011
- Post-doc, MIT, 2011-2013
- Post-doc, ETH Zürich, 2014-2017
- Adjunct professor, University of Turku, 2017
- Senior lecturer, University of Turku, 2017-
Teaching
- SOMO1021 - Advanced genetics (2018)
- FYGE2242 - Laboratory course of microbial genetics (2018)
- BIOL1301 - Fundamentals of genetics (2018)
- FYGE 4031 - Laboratory methods in genetics (2018)
- BIOL3050 - Bioinformatics for biologists (2019)
- BIOL3200 - BSc seminars (2019)
- BIOL1301 - Fundamentals of genetics (2019)
- FYGE 4031 - Laboratory methods in genetics (2019)
Research
- Single cell genomics of bacteria and small eukaryotes
- Horizontal transfer of antibiotic resistance genes
- Quantitative applications of NGS
Publications
Ecology determines how low antibiotic concentration impacts community composition and horizontal transfer of resistance genes (2018)
Communications Biology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Archaea are prominent members of the prokaryotic communities colonizing common forest mushrooms (2018)
Canadian Journal of Microbiology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Host range of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant influent and effluent (2018)
FEMS Microbiology Ecology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Single-cell mass spectrometry reveals the importance of genetic diversity and plasticity for phenotypic variation in nitrogen-limited Chlamydomonas (2017)
ISME Journal
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Innovaatiota eurooppalaisittain ja amerikkalaisittain (2017)
Tiedepolitiikka
(Kirjoitus tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (B1))
Corrigendum: Mobile genes in the human microbiome are structured from global to individual scales (vol 535, pg 435, 2016) (2017)
Nature
(O2 Muu julkaisu )
Evaluating the mobility potential of antibiotic resistance genes in environmental resistomes without metagenomics (2016)
Scientific Reports
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))