Johanna Hynninen

Circulating tumor DNA-based copy-number profiles enable monitoring treatment effects during therapy in high-grade serous carcinoma (2023)

Biomedicine and Pharmacotherapy

Nguyen Mai TN, Rajavuori Anna, Huhtinen Kaisa, Hietanen Sakari, Hynninen Johanna, Oikkonen Jaana, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A platform for efficient establishment and drug-response profiling of high-grade serous ovarian cancer organoids (2023)

Developmental Cell

Senkowski Wojciech., Gall-Mas Laura, Falco Matias Marin, Li Yilin, Lavikka Kari, Kriegbaum Mette C., Oikkonen Jaana, Bulanova Daria, Pietras Elin J., Voßgröne Karolin, Chen Yan Jun., Erkan Erdogan Pekcan, Dai Jun, Lundgren Anastasia, Grønning Høg Mia Kristine, Larsen Ida Marie, Lamminen Tarja, Kaipio Katja, Huvila Jutta, Virtanen Anni, Engelholm Lars, Christiansen Pernille, Santoni-Rugiu Eric, Huhtinen Kaisa, Carpén Olli, Hynninen Johanna, Hautaniemi Sampsa, Vähärautio Anna, Wennerberg Krister

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Toxicity and therapy outcome associations in LIG3, SLCO1B3, ABCB1, OPRM1 and GSTP1 in high-grade serous ovarian cancer (2023)

Basic and Clinical Pharmacology and Toxicology

Deng Feng, Laasik Maren, Salminen Liina, Lapatto Lauri, Huhtinen Kaisa, Li Yilin, Hautaniemi Sampsa, Hynninen Johanna, Niemi Mikko, Lehtonen Rainer

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

H&E image analysis pipeline for quantifying morphological features (2023)

Journal of Pathology Informatics

Ariotta Valeria, Lehtonen Oskari, Salloum Shams, Micoli Giulia, Lavikka Kari, Rantanen Ville, Hynninen Johanna, Virtanen Anni, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A Subset of Secreted Proteins in Ascites Can Predict Platinum-Free Interval in Ovarian Cancer (2022)

Cancers

Carroll Molly J, Kaipio Katja, Hynninen Johanna, Carpen Olli, Hautaniemi Sampsa, Page David, Kreeger Pamela K

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer (2022)

Science Advances

Zhang Kaiyang, Erkan Erdogan Pekcan, Jamalzadeh Sanaz, Dai Jun, Andersson Noora, Kaipio Katja, Lamminen Tarja, Mansuri Naziha, Huhtinen Kaisa, Carpén Olli, Hietanen Sakari, Oikkonen Jaana, Hynninen Johanna, Virtanen Anni, Häkkinen Antti, Hautaniemi Sampsa, Vähärautio Anna

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Optimized detection of homologous recombination deficiency improves the prediction of clinical outcomes in cancer (2022)

npj Precision Oncology

Perez-Villatoro Fernando, Oikkonen Jaana, Casado Julia, Chernenko Anastasiya, Gulhan Doga C., Tumiati Manuela, Li Yilin, Lavikka Kari, Hietanen Sakari, Hynninen Johanna, Haltia Ulla-Maija, Tyrmi Jaakko S., Laivuori Hannele, Konstantinopoulos Panagiotis A., Hautaniemi Sampsa, Kauppi Liisa, Färkkilä Anniina

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Effects of Wee1 inhibitor adavosertib on patient-derived high-grade serous ovarian cancer cells are multiple and independent of homologous recombination status (2022)

Frontiers in Oncology

Roering Pia, Siddiqui Arafat, Heuser Vanina D, Potdar Swapnil, Mikkonen Pia, Oikkonen Jaana, Li Yilin, Pikkusaari Sanna, Wennerberg Krister, Hynninen Johanna, Grenman Seija, Huhtinen Kaisa, Auranen Annika, Carpén Olli, Kaipio Katja

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability (2022)

Laboratory Investigation

Jamalzadeh Sanaz, Häkkinen Antti, Andersson Noora, Huhtinen Kaisa, Laury Anna, Hietanen Sakari, Hynninen Johanna, Oikkonen Jaana, Carpén Olli, Virtanen Anni, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A Novel Two-Lipid Signature Is a Strong and Independent Prognostic Factor in Ovarian Cancer (2021)

Cancers

Salminen Liina, Braicu EIena, Lääperi Mitja, Jylhä Antti, Oksa Sinikka, Hietanen Sakari, Sehouli Jalid, Kulbe Hagen, du Bois Andras du, Mahner Sven, Harter Philipp, Carpen Oolli, Huhtinen Kaisa, Hynninen Johanna, Hilvo Mika

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Contact

Links

Areas of expertise

Publications

Sort by:

Circulating tumor DNA-based copy-number profiles enable monitoring treatment effects during therapy in high-grade serous carcinoma (2023)

A platform for efficient establishment and drug-response profiling of high-grade serous ovarian cancer organoids (2023)

Toxicity and therapy outcome associations in LIG3, SLCO1B3, ABCB1, OPRM1 and GSTP1 in high-grade serous ovarian cancer (2023)

H&E image analysis pipeline for quantifying morphological features (2023)

A Subset of Secreted Proteins in Ascites Can Predict Platinum-Free Interval in Ovarian Cancer (2022)

Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer (2022)

Optimized detection of homologous recombination deficiency improves the prediction of clinical outcomes in cancer (2022)

Effects of Wee1 inhibitor adavosertib on patient-derived high-grade serous ovarian cancer cells are multiple and independent of homologous recombination status (2022)

QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability (2022)

A Novel Two-Lipid Signature Is a Strong and Independent Prognostic Factor in Ovarian Cancer (2021)