Pekka Ruusuvuori

Virtual staining for histology by deep learning (2024)

Trends in Biotechnology

Latonen, Leena; Koivukoski, Sonja; Khan, Umair; Ruusuvuori, Pekka

(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)

Virtuaalivärjäys mahdollistaa ympäristöystävällisempää histologiaa kemikaaleja vähentämällä (2024)

Duodecim

Koivukoski, Sonja; Ruusuvuori, Pekka; Latonen, Leena

(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)

The ACROBAT 2022 Challenge : Automatic Registration Of Breast Cancer Tissue (2024)

Medical Image Analysis

Weitz, Philippe; Valkonen, Masi; Solorzano, Leslie; Carr, Circe; Kartasalo, Kimmo; Boissin, Constance; Koivukoski, Sonja; Kuusela, Aino; Rasic, Dusan; Feng, Yanbo; Pouplier, Sandra Sinius; Sharma, Abhinav; Eriksson, Kajsa Ledesma; Robertson, Stephanie; Marzahl, Christian; Gatenbee, Chandler D.; Anderson, Alexander R.A.; Wodzinski, Marek; Jurgas, Artur; Marini, Niccolò; Atzori, Manfredo; Müller, Henning; Budelmann, Daniel; Weiss, Nick; Heldmann, Stefan; Lotz, Johannes; Wolterink, Jelmer M.; De Santi, Bruno; Patil, Abhijeet; Sethi, Amit; Kondo, Satoshi; Kasai, Satoshi; Hirasawa, Kousuke; Farrokh, Mahtab; Kumar, Neeraj; Greiner, Russell; Latonen, Leena; Laenkholm, Anne-Vibeke; Hartman, Johan; Ruusuvuori, Pekka; Rantalainen, Mattias

(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)

Platinum-based drugs induce phenotypic alterations in nucleoli and Cajal bodies in prostate cancer cells (2024)

Cancer Cell International

Batnasan Enkhzaya, Kärkkäinen Minttu, Koivukoski Sonja, Sadeesh Nithin, Tollis Sylvain, Ruusuvuori Pekka, Scaravilli Mauro, Latonen Leena

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Volumetric analysis of the terminal ductal lobular unit architecture and cell phenotypes in the human breast (2024)

Cell Reports

Paavolainen, Oona; Peurla, Markus; Koskinen, Leena M.; Pohjankukka, Jonna; Saberi, Kamyab; Tammelin, Ella; Sulander, Suvi-Riitta; Valkonen, Masi; Mourao, Larissa; Boström, Pia; Brück, Nina; Ruusuvuori, Pekka; Scheele, Colinda L.G.J.; Hartiala, Pauliina; Peuhu, Emilia

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

The effect of neural network architecture on virtual H&E staining: Systematic assessment of histological feasibility (2023)

Patterns

Khan Umair, Koivukoski Sonja, Valkonen Mira, Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Genomic characterization of IDH-mutant astrocytoma progression to grade 4 in the treatment setting (2023)

Acta Neuropathologica Communications

Rautajoki Kirsi, Jaatinen Serafiina, Hartewig Anja, Tiihonen Aliisa, Annala Matti, Salonen Iida, Valkonen Masi, Simola Vili, Vuorinen Elisa M., Kivinen Anni, Rauhala Minna, Nurminen Riikka, Maass Kendra, Lahtela Sirpa-Liisa, Jukkola Arja, Yli-Harja Olli, Helen Pauli, Pajtler Kristian, Ruusuvuori Pekka, Haapasalo Joonas, Zhang Wei, Haapasalo Hannu, Nykter Matti

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Interobserver reproducibility of cribriform cancer in prostate needle biopsies and validation of International Society of Urological Pathology criteria (2023)

Histopathology

Egevad L, Delahunt B, Iczkowski KA, van der Kwast T, van Leenders GJLH, Leite KRM, Pan CC, Samaratunga H, Tsuzuki T, Mulliqi N, Ji XY, Olsson H, Valkonen M, Ruusuvuori P, Eklund M, Kartasalo K

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Domain-specific transfer learning in the automated scoring of tumor-stroma ratio from histopathological images of colorectal cancer (2023)

PLoS ONE

Petäinen Liisa, Väyrynen Juha P., Ruusuvuori Pekka, Pölönen Ilkka, Äyrämö Sami, Kuopio Teijo

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

STAGETOOL, a Novel Automated Approach for Mouse Testis Histological Analysis (2023)

Endocrinology

Meikar Oliver, Majoral Daniel, Heikkinen Olli, Valkama Eero, Leskinen Sini, Rebane Ana, Ruusuvuori Pekka, Toppari Jorma, Makela Juho-Antti, Kotaja Noora

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Contact

Publications

Sort by:

Virtual staining for histology by deep learning (2024)

Virtuaalivärjäys mahdollistaa ympäristöystävällisempää histologiaa kemikaaleja vähentämällä (2024)

The ACROBAT 2022 Challenge : Automatic Registration Of Breast Cancer Tissue (2024)

Platinum-based drugs induce phenotypic alterations in nucleoli and Cajal bodies in prostate cancer cells (2024)

Volumetric analysis of the terminal ductal lobular unit architecture and cell phenotypes in the human breast (2024)

The effect of neural network architecture on virtual H&E staining: Systematic assessment of histological feasibility (2023)

Genomic characterization of IDH-mutant astrocytoma progression to grade 4 in the treatment setting (2023)

Interobserver reproducibility of cribriform cancer in prostate needle biopsies and validation of International Society of Urological Pathology criteria (2023)

Domain-specific transfer learning in the automated scoring of tumor-stroma ratio from histopathological images of colorectal cancer (2023)

STAGETOOL, a Novel Automated Approach for Mouse Testis Histological Analysis (2023)